De in Denemarken verblijvende Nederlanders, voornamelijk zeelieden, werden opgevangen in huizen van het comité. Van 21 juni tot en met 1 november 1945 vonden er transporten plaats die Nederlandse vluchtelingen terug brachten naar Nederland. Een aantal maal werden ook repatrianten uit Zweden meegenomen naar Nederland.
Zeelieden werden niet gerepatrieerd, tenzij zij in dienst van de Duitse weermacht of marine waren geweest. De andere zeelieden werden ingezet op Nederlandse schepen die in Denemarken aanwezig waren.