- Uitvoer van de regelingen met betrekking tot herstel van schade aan de binnenvaart-, de koopvaardij- en de vissersvloot en al het drijvende materieel ten tijde van de Duitse bezetting van Nederland
- Uitvoer van de Wet op de Materiële Oorlogsschade (1950)
In 1949 werd de taakomschrijving van de Afdeling Vaartuigen geformuleerd: 'het regelen, vaststellen en afwikkelen van oorlogsschaden, toegebracht aan vaartuigen en andere drijvende objecten, alsmede aan de daarbij behorende scheepsuitrusting en scheepsinboedel. Het beoordelen en adviseren van de materiaal-aanvragen; de opruiming van scheepswrakken, mede in overleg met de Rijswaterstaat en de Afdeling Domeinen van het Ministerie van Financiën. Optreden als technisch-adviserende instantie voor:
- het Directoraat-Generaal van Scheepsvaart inzake de regeling van oorlogsschaden aan vaartuigen, enz. volgens de Zee- en Luchtvaartverzekering-1939
- het Ministerie van Landbouw, Visserij en Voedselvoorziening inzake de Visserijvloot
- het Ministerie van Financiën inzake de defensie-, oorlogsbuit- en militaire vorderingsschaden
- het Directoraat-Generaal van het Verkeer inzake de binnenvaartvloot.'
In 1955 werd de taakomschrijving geherformuleerd. De Afdeling Vaartuigen werd gedefinieerd als een 'orgaan ter uitvoering van de Wet op de Materiële Oorlogsschaden en de Wet op de Watersnoodschade 1953 met betrekking tot vaartuigen behorende bij tot de binnenvaart-, de koopvaardij- en de visserijvloot en ander drijvend of vaarbaar materieel, de scheepsuitrusting, enz.' De Afdeling was een 'technisch adviserend orgaan' voor:
- de Directie van Scheepvaart en Gemachtigden der Regering ter uitvoering van de Zee-, en Luchtvaartverzekeringswet 1939 en de Wet Vergoeding Molestschade Binnenschepen
- de Directie van de Rijkswaterstaat met betrekking tot baggermaterieel en andere vaartuigen in gebruik bij de Rijkswaterstaat
- de Directie van het Verkeer inzake de Binnenvaartvloot
- het Ministerie van Financiën inzake de regeling van oorlogs- en watersnoodschade aan pleziervaartuigen, van vaartuigen Publiekrechtelijke Lichamen, van oorlogsbuitzaken, enz.
- de Herstelbank aangaande de financiering van het herstel en de bouw van vaartuigen vanwege oorlogsschade, enz.
- de Directie der Visserijen inzake de visserijvloot;
- de Inspectie Verkeerswezen - Ministerie van Oorlog voor de aldaar in huur en gebruik zijnde binnenschepen
In 1965 werd de taakomschrijving voor een tweede keer geherformuleerd. De Afdeling Vaartuigen kreeg tot taak:
'I. Het uitbrengen van adviezen aan overheidsinstanties:
a. met betrekking tot technische en financieringsvraagstukken terzake van bouw, onderhoud, modernisering, huur en gebruik van vaartuigen voor de binnenvaart, de koopvaardij en visserij alsmede voor onderwijsdoeleinden, baggerwerken e.d.;
b. betreffende de regeling van scheepsschade, oorlogsschade daaronder begrepen, en betreffende wrakopruiming.
II. Secretariaat van de Commissie Ontwikkeling Zeevisserij'.